員工福利設置會計科目為:應付員工薪酬。是由于以下原因：

應付員工薪酬是企業根據有關規定應付給員工的各種薪酬,依照"工資,獎金,津貼,補助"、"員工福利"、"社會保險費"、"住房公積金"、"工會經費"、"員工教育經費"、"解除員工勞作聯系補償"、"非貨幣性福利"、"其它與獲得員工提供的服務相關的支出" 等應付員工薪酬項目進行明細核算。

企業依照有關規定向員工付出福利費等,借記"應付員工薪酬--福利費"科目,貸記"銀行存款"、"庫存現金"等科目,企業從應付員工薪酬中扣還的各種金錢(代墊的家屬藥費、個人所得稅等),借記"應付員工薪酬"科目,貸記"銀行存款"、"庫存現金"、"其他應收款"、"應交稅費--應交個人所得稅"等科目。